Pourquoi cartographier les épitopes?

Cartographie des épitopes – Un élément essentiel au développement d’anticorps thérapeutiques

Pepscan a inventé la cartographie des épitopes à base de peptides. Nos 25 ans d’expérience dans la chimie avancée et appliquée des peptides nous permettent de proposer des définitions d’épitopes précises, claires et directement applicables aux anticorps de nos clients. L’expérience de nos scientifiques en immunologie, biochimie, biologie structurale et cellulaire et leur expertise alliées aux réseaux de peptides que nous avons développés en interne et à notre technologie exclusive CLIPS™ nous ont permis de nous doter d’une plateforme unique capable de servir nos clients dans de nombreux domaines.

Compréhension fonctionnelle et sélection des anticorps

La détermination du site de liaison permettra d’établir la relation entre l’épitope et les aspects fonctionnels d’un anticorps, par exemple si la liaison a lieu au niveau d’un site similaire à celui du ligand naturel. En outre, la cartographie des épitopes peut être utilisée pour sélectionner les anticorps qui ciblent des domaines ou épitopes spécifiques sur une protéine, par exemple pour la mise au point d’un test (diagnostique) ou d’un médicament thérapeutique.

Propriété intellectuelle et dépôts réglementaires

La cartographie des épitopes est une étape cruciale et inévitable dans le développement d’anticorps thérapeutiques. Elle joue un rôle clé dans la protection de la propriété intellectuelle et l’approbation de la FDA/l’AEM, et donc dans la protection des intérêts de votre société. Mais, de façon étonnante, moins de 10 % des brevets déposés concernant des anticorps mentionnent la cartographie des épitopes. Pepscan est cité dans la majorité des brevets européens déposés en 2019 et qui mentionnent la cartographie des épitopes.

  • Propriété intellectuelle – Les informations sur les sites de liaison précis, aussi appelés épitopes, sont utiles pour justifier des nouvelles demandes de brevet et pour satisfaire à l’exigence de description écrite pour les revendications d’anticorps plus larges. Les données de cartographie des épitopes peuvent également servir d’argument pour prouver la liberté d’exploitation dans le cas où les revendications d’un brevet portent sur un épitope donné différent de celui de votre propre anticorps. Dans certains cas, les aspects de la propriété intellectuelle peuvent se résumer à de petites différences au niveau des acides aminés, et elles peuvent être élucidées grâce à notre technologie de cartographie fine.
  • Dépôts réglementaires – La FDA et l’AEM recommandent l’inclusion d’informations spécifiques sur le site de liaison dans les dossiers réglementaires pour les nouveaux anticorps

Notre plateforme de cartographie des épitopes prend en charge non seulement vos revendications de propriété intellectuelle, mais elle permet également de parvenir à une compréhension fonctionnelle qui favorise la sélection des meilleurs anticorps candidats avec une spécificité privilégiée par :

  • Comparaison de deux anticorps ayant un épitope similaire
  • Classification des différents anticorps dans des groupes distincts en fonction de leur épitopes et mode de liaison à la cible
  • Identification des positions des divers acides aminés essentiels au niveau de l’épitope
  • Compréhension détaillée des exigences au niveau des acides aminés afin d’obtenir une réactivité inter-espèces ou multi-souches

La plupart de ces aspects peuvent être cartographiés à l’aide de notre cartographie linéaire, conformationnelle ou discontinue, et une approche plus approfondie est parfois nécessaire pour caractériser les propriétés d’un seul acide aminé à l’aide d’une cartographie fine.